Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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SH3BP4Q9P0V3 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SH3BP4Q9P0V3 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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