Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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ECM1Q16610 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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ECM1Q16610 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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ECM1Q16610 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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ECM1Q16610 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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