Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SNAPC1Q16533 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms