Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
NTRK3Q16288 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.3 ms