Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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CCINQ13939 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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CCINQ13939 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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CCINQ13939 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CCINQ13939 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCINQ13939 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCINQ13939 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCINQ13939 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCINQ13939 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCINQ13939 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCINQ13939 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCINQ13939 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCINQ13939 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCINQ13939 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCINQ13939 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCINQ13939 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCINQ13939 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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