Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RUNX3Q13761 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms