Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
KCNMA1Q12791 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms