Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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