Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.48
TIMMDC1Q9NPL8 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 KRTAP2-5P-201ENST00000446109 396 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TIMMDC1Q9NPL8 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms