Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms