Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IMPG1Q17R60 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms