Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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CTF1Q16619 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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CTF1Q16619 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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CTF1Q16619 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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CTF1Q16619 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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CTF1Q16619 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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CTF1Q16619 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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CTF1Q16619 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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CTF1Q16619 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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CTF1Q16619 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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