Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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DDB1Q16531 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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DDB1Q16531 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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DDB1Q16531 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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DDB1Q16531 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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