Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms