Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MTMR3Q13615 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MTMR3Q13615 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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