Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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PEX6Q13608 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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PEX6Q13608 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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PEX6Q13608 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PEX6Q13608 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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