Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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TCIRG1Q13488 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCIRG1Q13488 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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