Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
SNTA1Q13424 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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SNTA1Q13424 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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SNTA1Q13424 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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