Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 OR52N1-202ENST00000641645 2545 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
CLN3Q13286 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
CLN3Q13286 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms