Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRDNQ13061 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms