Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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HCN4Q9Y3Q4 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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HCN4Q9Y3Q4 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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HCN4Q9Y3Q4 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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