Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PUF60Q9UHX1 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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