Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CGGBP1Q9UFW8 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CGGBP1Q9UFW8 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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