Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RECQL-204ENST00000444129 3702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FDFT1-222ENST00000538689 2289 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 DIO2-202ENST00000438257 6136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACOT13-203ENST00000537591 4391 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSD4-205ENST00000441564 11234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ELP2-203ENST00000358232 8459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 E2F8-201ENST00000250024 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01588-202ENST00000528300 3208 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC114776.1-201ENST00000414159 4395 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANKRD20A5P-201ENST00000431648 3556 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 CELF2-209ENST00000631460 5538 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDK6-201ENST00000265734 11612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 DAZ2-207ENST00000382449 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 EML5-201ENST00000380664 5910 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP8A2-204ENST00000381655 9575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF844-201ENST00000439326 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 DISP2-201ENST00000267889 12614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 BCOR-203ENST00000378455 6338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 HDAC9-201ENST00000401921 3254 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZBTB18-201ENST00000358704 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms