Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
KNOP1Q1ED39 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
KNOP1Q1ED39 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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