Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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CCDC142Q17RM4 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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CCDC142Q17RM4 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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CCDC142Q17RM4 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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CCDC142Q17RM4 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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CCDC142Q17RM4 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
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CCDC142Q17RM4 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CCDC142Q17RM4 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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