Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 PPARGC1A-217ENST00000613098 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
FOXD1Q16676 JAZF1-201ENST00000283928 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 TNFRSF19-203ENST00000382263 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 ROBO2-202ENST00000461745 8946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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FOXD1Q16676 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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FOXD1Q16676 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 BTK-210ENST00000621635 2767 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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FOXD1Q16676 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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FOXD1Q16676 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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FOXD1Q16676 TMEM2-205ENST00000377066 5217 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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FOXD1Q16676 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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FOXD1Q16676 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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FOXD1Q16676 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
FOXD1Q16676 ADGRL3-213ENST00000509896 5069 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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