Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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