Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HERPUD1Q15011 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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