Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
ERV3-1Q14264 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms