Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CBFBQ13951 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.9 ms