Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 TRAV12-1-201ENST00000390433 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 CYP4F34P-201ENST00000425951 481 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RN7SL325P-201ENST00000460434 283 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC004494.1-202ENST00000573820 480 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AL121809.2-201ENST00000613169 341 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 DCDC2-201ENST00000378450 3684 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC132219.2-201ENST00000624416 2327 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SNPHO15079 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 CEP41-213ENST00000489512 3161 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 VEPH1-201ENST00000362010 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SNPHO15079 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RN7SL775P-201ENST00000498361 336 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SNPHO15079 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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