Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP35Q9P2H5 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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