Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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PTPRNQ16849 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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PTPRNQ16849 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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PTPRNQ16849 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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PTPRNQ16849 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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PTPRNQ16849 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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PTPRNQ16849 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTPRNQ16849 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
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PTPRNQ16849 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
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PTPRNQ16849 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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PTPRNQ16849 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTPRNQ16849 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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