Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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SGCAQ16586 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SGCAQ16586 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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