Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
SIX1Q15475 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms