Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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PUM3Q15397 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
PUM3Q15397 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
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