Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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