Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SEMA3AQ14563 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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SEMA3AQ14563 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SEMA3AQ14563 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
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SEMA3AQ14563 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
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