Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CAPSQ13938 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms