Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
PDE3BQ13370 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PDE3BQ13370 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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