Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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FOXQ1Q9C009 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
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FOXQ1Q9C009 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXQ1Q9C009 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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