Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
UHRF1Q96T88 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms