Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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LAMA3Q16787 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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LAMA3Q16787 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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LAMA3Q16787 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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LAMA3Q16787 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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LAMA3Q16787 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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LAMA3Q16787 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC2.46□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
LAMA3Q16787 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
LAMA3Q16787 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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