Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
CLPPQ16740 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms