Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
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