Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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RPE65Q16518 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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RPE65Q16518 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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RPE65Q16518 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
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RPE65Q16518 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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RPE65Q16518 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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