Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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VPS72Q15906 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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VPS72Q15906 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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VPS72Q15906 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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VPS72Q15906 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
VPS72Q15906 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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