Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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NKX1-1Q15270 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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NKX1-1Q15270 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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NKX1-1Q15270 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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NKX1-1Q15270 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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NKX1-1Q15270 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 LDB2-216ENST00000515064 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 INTS2-202ENST00000444766 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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