Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
HERC3Q15034 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
HERC3Q15034 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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